Keto-diæten kan forårsage lavt blodtryk, nyresten, forstoppelse, næringsstofmangel og en øget risiko for hjertesygdomme. Strenge kostvaner som keto kan også forårsage social isolation eller forstyrret spisning. Keto er ikke sikkert for dem med nogen tilstande, der involverer bugspytkirtlen, leveren, skjoldbruskkirtlen eller galdeblæren.