Frugt, grøntsager, bælgfrugter, nødder og fuldkorn fodrer sunde bakterier. Undgå stærkt forarbejdede fødevarer. De indeholder ofte ingredienser, der enten undertrykker 'gode' bakterier eller øger 'dårlige' bakterier. Probiotiske fødevarer, såsom levende yoghurt, kan tilskynde flere mikrober til at vokse.